Bem... Se considerarmos que a Copa do Mundo já inicia naquela fase final, de 8 grupos com 4 seleções, a resposta é simples: não, nenhum goleiro marcou gols na Copa do Mundo propriamente dita.
Mas já chegaram MUITO perto de fazer, uma vez contra a Bulgária, em 1998, e depois contra a Eslovênia, em 2002 (confira os vídeos ao final deste post).
Porém, quando se trata de FIFA sempre tem um "porém", a FIFA considera as eliminatórias como jogos de Copa do Mundo. Sim, é exatamente isso que você leu. De acordo com a FIFA, os jogos eliminatórios são parte da Copa, sendo a sua, digamos, primeira fase.
Levando em conta esse entendimento, a Copa do Mundo tem a seguinte composição: Fase classificatória, Grupos, Eliminatórias.
Uma vez que a Copa do Mundo já começa nas Eliminatórias, a fase de classificação, a resposta para a pergunta muda e se torna um grande "SIM, um goleiro já marcou gols em jogos de Copa."
Quem? O lendário goleiro artilheiro (que perde apenas para Rogério Ceni) paraguaio Chilavert marcou 7 gols nas eliminatórias para as Copas do Mundo, segue a lista abaixo:
27/08/89 - Contra Colômbia (pênalti)
15/08/93 - Contra Peru (pênalti)
01/09/96 - Contra Argentina (pênalti)
07/10/2000 - Contra Colômbia (falta)
15/11/2000 - Contra Peru (pênalti)
05/09/2001 - Contra Bolívia (falta)
07/10/2001 - Contra Argentina (pênalti)
Chilavert x Bulgária:
Chilavert x Eslovênia: